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广东红柠檬一般用茎段来进行扦插繁殖，就是剪下茎段，在适宜的条件下让其下部形成不定根，从而成为一个完整独立的新植株的方法。剪下用于扦插的茎段称为插穗或插条。扦插繁殖的具体步骤如下：
①基质的准备：
用于让插条生根的材料叫扦插基质。基质可使用泥土或干净的河沙。在花盆底下先填入一层粗的泥土或石砾，再装入基质，填满约盆高的8成即可。
②剪取插条：
在砧木株上剪取粗壮的枝条，把上半部分剪去，剩下较老的部分再剪成约15厘米长的枝段，把枝段的叶及刺全部剪去，或者留下上部2片叶，把每片叶再剪去一半。之后把枝段基部用利刀斜削一刀，使切口成为马蹄形，这样插条就准备好了。
③扦插：
用一根与插条大小差不多的竹棒，在基质上先插个洞，约为插条的2/3深，然后再把插条插入洞中。为了促进插条的生根，可把插条基部切口稍微沾湿后再沾上生根粉，然后进行扦插。
④插后的管理：
插后浇透水，把盆放在阴处，让其生根发芽，期间要注意经常浇水，保持基质湿润。约20～30天后就可开始发根，同时把盆移至阳光处，并且只留下最顶端的一个枝条即可，其余的枝条则需要整个抹除，以使顶端的枝条生长粗壮。如果是用沙子作为扦插基质的，生根后需要移出种入装有泥土的盆中。
砧木扦插后大概经历一年左右的时间，使其生长有足够的粗度，用于嫁接效果才更好。期间要进行正常的浇水、施肥、病虫害防治、除杂草等工作。广东通常在秋冬季扦插砧木，一年后同样的时间用于进行嫁接繁殖。
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