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可引起萝卜发黑腐烂有二种病害和一种害虫，所以首先要诊断出引起萝卜发黑的原因。
1.萝卜黑根病：多发于多雨水的春秋二季，病部表皮呈黑褐色，病健分界不明显，使肉质根病部不规则开裂，并向内部扩展，侵染肉质根内部组织，引起腐烂。（注意诊断区别为表皮发黑）
2.萝卜黑腐病：在萝卜苗期至成株期都能侵染为害；多发于高温多雨的夏秋季，萝卜生长的中后期，由感病的老叶引发病菌侵染肉质根，造成维管束或内根中心变黑，并容易引起软腐病而有臭味，但直根外部形态上有时明显症状。（注意诊断区别为内根内部发黑）
3.根蛆：主要发生期是5月上中旬至11月，发生原因是种植时使用了未经充分腐熟的有机肥料，或田间有诱集种蝇成虫产卵基质肥料类残留物。当根蛆幼虫发育生长为高龄时，从根基部入侵蛀食危害，导致萝卜根茎腐烂发黑。但通常可在发黑腐烂部位找到虫蛆的活体。
萝卜黑根腐烂的防治方法：
由二种病害引发的黑根腐烂，发生主要与多雨田间高湿有关，多开沟系防止积水是防病的关键，萝卜黑根病、萝卜黑腐病在发病前可用普力克600-800倍浇根（每株用药液150-250克）2-3次预防。如果是由根蛆引起的黑根腐烂，在根蛆初发期可用90%晶体敌百虫1000倍、80%敌敌畏乳油1000倍、50%辛硫磷乳油1000倍、40%乐果乳油1000倍液浇根（每株用药液150-250克）防治。
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