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辣椒一代杂种的制种关键是杂交种子的纯度和产量，而影响纯度和产量的因素有亲本种子纯度、栽培管理、隔离和授粉技术等，其中以授粉技术尤为重要。现谈谈授粉的过程及方法。
1授粉前的准备工作
1.1授粉管与印油笔的制作
授粉管为一支空心玻璃管，一端顶部开口，另一端侧面开了个小孔。管长6cm，外径4mm，内径3mm，小孔直径1.5mm。制管时要使小孔边缘足够光滑。
印油笔制作方法：将绘画用水彩笔的笔芯去掉，在笔筒中灌入印油即可使用。印油配方为75%～85%铅印油墨（红色）加上15%～25%油漆（清漆或红色油漆），再加适量食用油（如菜油、棉籽油、花生油等植物油）调浓度。
1.2田检与植株调整
检查父母本纯度，除杂去劣。父母本植株要疏去第1节位的花、果。母本植株上已开放的花和所有果实全部摘除，最好把门椒以下发育不良的细弱枝条也剪掉。
2花粉收集与杂交授粉
2.1花粉收集
每天上午6∶00～8∶00（温度低、阴雨天可适当推迟），采摘父本植株上将要开放的花蕾（花冠充分发白，前端稍裂）或刚开放但花药未裂开的花，立即用镊子取出花药，置于器皿中，在弱光干燥处晾干，用60～100目的花粉筛筛取花粉，装入授粉管内，再用橡皮塞将管口堵严备用。在生产中，最好使用当天的新鲜花粉，少用或不用隔日花粉。
2.2授粉时间、节位和蕾龄
授粉时期在不同地区略有差别，合肥地区以5月初至6月中旬较为适宜。
每日授粉时间因气温和空气湿度变化而略有变化。温度较低、空气湿度较大时，开花时间延迟，则相应推迟授粉；反之则提前授粉。一般以上午7∶00～10∶00为宜，其中8∶00～9∶00最佳，因为这段时间柱头分泌物增多；下午以3∶00后为宜。如果温度适宜，可全天授粉。
授粉的最佳节位为第2～5节。若留第1节的花授粉制种，会影响植株的营养生长；第5节以上的果实种子轻、质量差。
判断授粉最佳蕾龄的标准为：花蕾已充分膨大，花苞变为白色，用手轻轻一捏即开裂。这样的花蕾，花柱已成熟，花药未裂。若花蕾小（绿白色），则不易坐果，产籽量也少。
2.3授粉的操作过程及注意事项
授粉管用橡皮筋固定在印油笔的中前部，有小孔的一端靠近笔头。握笔姿势：用右手的食指和中指夹住笔杆前端，笔杆后端在母指与食指之间，注意要使授粉管小孔朝上方。授粉时，左手捏住花梗与花托交接处不要动，右手母指和食指轻轻捏住花冠靠近花托的部位，缓慢扭动，花冠和花药即被去掉（花药与花冠是连在一起的），露出花柱和子房。然后将花柱垂直伸入授粉管的小孔内，蘸上饱和的花粉，再用印油笔在花梗上涂一下，以作标记。
授粉过程中，在寻找可以授粉的花蕾时，不要用手扒叶片，可用手提着植株上部的几个叶片，轻轻扒开，因为辣椒枝叶较脆，易折断。此外，在扭花冠时，不要弄伤或折断花柱（花柱很娇嫩）；授粉后，不要让花柱与叶子接触。花粉管在使用过程中，要经常竖起来，使花粉保持充满管底部的状态。
授粉时遇到已开放的花要摘掉，遇到病株要及时拔除。授粉期结束后，要及时摘除发白的花蕾，一般连接3层花，上面打顶。同时要加强肥水管理，防治病虫害等。
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