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在育苗环境中，温度对秧苗生长的影响最大。温度过低，幼苗生长缓慢或停止成长，形成老苗或僵老苗，而且温度过低会影响花芽分化，温度过高，尤其是夜温过高，幼苗生长速度过快，易形成徒长苗。洋葱育苗处于冬春低温时期，多在大棚、温室设施内进行，其温度变化规律是：白天气温逐渐上升，到下午1时左右温达到最高，接着开始下降，到第二天早上5~6时达到最低值，每天形成一定的温差。设施容积越小，升温越快，降温也快，温差也大：反之，设施容积越大，则升温越慢，降温也慢，温差也小。设施内的气温高天四周。地温变化规律与气温相似，相比气温稳定。最高地温出现时间比气温迟2小时，最低地温出现， 比气温晚1~2小时。
育苗温度主要指空气温度、床上温度和昼夜温差三个方面。应坚持白天高、夜间低：晴天高，阴天低：土温高，气温低的原则，以减少呼吸消耗。同时也以掌握出苗前高，出苗后低：缓苗前高，缓后低，使秧苗健壮地成长发育。夜间与白天温差10℃为好，这样，白天有光合作用，增加养分积累，晚上可以降低呼吸作用，减少呼吸消耗。土温影响着根系的生长和吸收水分、养分的功能，保持适宜的土温是培育的基础，一般以20~25℃ 为宜。
洋葱育苗处在冬春低温季节，温度调节控主要是设法增加温度和保持混充。具体措施有：
（1）选择优质覆盖物，增加太阳辐射能力，选择红外光和紫外光透过率高，保温性能好 ，强度大，寿命长的优质薄膜作覆盖物。具体见光照强度管理有关内容。
（2）采取多层覆盖可采大棚套小棚或大棚套中棚套小棚等多种多层覆盖形式，覆盖物外层选用优质薄膜，内层可根据需要采用薄膜、遮阳网、草帘等多种覆盖物。
（3）加强通风管理洋葱育苗期间温度的管理除覆盖及辅助加温外，很重要的一条措施是通风透气。1月份前后的晴好天气，一般在早上揭帘、薄膜上有水汽时重新覆盖。通气时间的及通风口的大小，应看天气和秧苗生长情况随时调节。晴天中午温暖无风，可将全部揭开，让秧苗多照直射光，风口应用草帘等遮住，不使冷风吹入床内。进入2月份下旬后，天气逐渐转暖，秧苗生长加快，更应加强通风，以防徒长。
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