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实践中，常发现种子播种后不出苗，这种现象主要是两个原因，一是种子发芽率低，二是苗床环境不理想。
洋葱育苗在冬季进行，此时的苗床条件一般均不能达到洋葱发芽的最佳条件，一旦种子发芽率较低，或其活力较低（如存放多年的陈种子），就常常会出现不出苗的问题。有时，种子发芽率较高，但还是不出苗，这很可能是以下几个原因：苗床内病菌多，由于病菌的侵害使得种子染病死亡：床土过干，种子得不到足够的水分，发芽中途停止，这种情况催芽育苗做更有可能：苗床上水分过多，氧气不足，使种子出现腐烂情况。
克服不出苗的方法有三个方面：第一，用高质量（籽粒饱满，发芽率高）的种子 播种，尽量不用陈种子。第二，创造一个良好的育苗环境，温度、水分、氧气（实际上是选用疏松的营养土，并掌握浇水方法）等尽量满足种子发芽出苗的要求。第三，采用上述两条后，如果不出苗，则应根据具体情况采用相应的方法。如果检查种子仍有活力，则是否是由于土壤板结、水分不足或水分过多引起，若是土结，则得疏松床土，若是水分不足，则适当洒水，若是水分过多（这种情况常常是很危险的，时间稍长，种子可能腐烂死亡），则苗床四周清沟排水，苗床内通风降温，必要可撒一些干净的细土。
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