南方气候潮湿多雨，土壤中的有机质及矿物元素容易流失，易造成缺素病。所以柑桔缺素病是南方柑桔产区中常见的一种生理病害。有些地方甚至颇为严重。但柑桔缺素病的症状与病毒类（包括植物菌原体和类细菌）引致的病害症状极为相似，不易区分。怎样才能把两类病害较准确地区分呢？首先
1、进行田间调查，观察病害的发生范围及田间分布状况。由于缺素病是土壤中缺乏某种矿质元素而引起的。因此发生范围是比较广阔。病株在果园中的分布比较普遍，比较均匀，没有由发病中心向周围扩展的现象。病毒病开始时往往先在局部地方发生（即发病中心），然后逐渐蔓延扩大。明显地有由发病中心向周围扩展、蔓延现象。病害在果园的分布是不均匀的。
2、缺素病与病毒类病害发病的植株虽然均表现为全株性发病，但发病的次序不一样。病毒类病害的症状表现首先是从树冠或枝梢的顶端开始的，然后其它部位陆续出现。而缺素病多数是先在树冠下部枝梢的叶片表现症状。有些缺素病如缺锌、缺锰素病也可在树冠顶部新梢叶片表现症状，这种与柑桔黄龙病的中期症状极为相似，但前者发病的叶片不变小变硬，而后者病叶变小变硬。
3、对病树加强管理，增施有机肥，特别是在叶面喷施疑为缺乏的某种微量元素溶液。病树的症状就会逐渐消退，树势慢慢会回复生长正常，则为缺乏某种元素病。因为这些措施对病毒类病害则完全无效。
4、传染试验是区分两类病害最准确的方法。取要鉴定的样本芽条嫁接（腹接或顶接）在健康的砧木苗上。经一段时间观察（一般1－2个月），如果砧木苗不表现与样本相同的症状，证明是缺素病。如果砧木苗表现与样本相同的症状，则证明是病毒类病害了。
5、矿物元素分析。取病树组织及果园土壤进行化学分析，测定其矿物元素成分及含量并与正常值进行比较，从而诊断出是否缺乏某一种元素。
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